Christian Vestergaards forskning omhandler inflammatoriske hudsygdomme, især de store sygdomsgrupper atopisk eksem (børneeksem), psoriasis og blæredannende sygdomme som bulløs pemfigoid. Et centralt fokus er, hvordan disse sygdomme viser sig og håndteres i almen praksis, herunder de udfordringer, som både praktiserende læger og patienter oplever. Forskningen omfatter desuden forekomsten af hudsygdomme i særlige patientgrupper, især gravide kvinder og patienter med flere samtidige autoimmune sygdomme.
Christian Vestergaard underviser i dermatologi og venerologi på lægeuddannelsens sidste semester. Han bidrager desuden aktivt til den postgraduate uddannelse af kommende speciallæger i dermatologi, lungesygdomme, øjensygdomme og øre-næse-halssygdomme. I samarbejde med Lægernes Uddannelsesfond (LUF) afholder han et årligt ugekursus i dermatologi for praktiserende læger. Hans forskningsgruppe har tilknyttet ph.d.-, kandidat- og bachelorstuderende.
Christian Vestergaard samarbejder bredt på tværs af afdelinger på Aarhus Universitetshospital og Aarhus Universitet. Da dermatologi er et relativt lille fagområde, er det afgørende, at samarbejdet også rækker ud over egen institution. Han samarbejder derfor nationalt med andre regioner og universitetshospitaler samt med forskningsmiljøer internationalt.
Christian Vestergaard er præsident for Nordic Dermatology Associations og bestyrelses medlem i European Academy of Dermato-Venerology (EADV)
